Diederik Burgersdijk is classicus verbonden aan University College Utrecht en het Cartesius Lyceum te Amsterdam. Als gastonderzoeker is hij verbonden aan de Radboud Universiteit te Nijmegen en Allard Pierson, het museum van de Universiteit van Amsterdam. Hij is redactielid van de serie Cultural Interactions in the Mediterranean bij Brill Publishers, van de Rivista storica dell’Antichità van de Universiteit van Bologna, en van Talanta, Proceedings of the Dutch Archaeological and Historial Society.
Hij treedt vaak op als moderator van Spui25, het culturele en academische centrum van de Universiteit van Amsterdam, en is redacteur van de jaarlijkse Homeruslezing. In de periode 2016-2020 was hij voorzitter van het Nederlands Klassiek Verbond (NKV), en in de periode 2008-2014 was hij, naast oprichter, voorzitter van de Stichting Zenobia.
Zijn specialisatie is de historiografie en retorica van de Romeinse keizertijd, waarover hij vele boeken en artikelen heeft gepubliceerd in verschillende talen, in internationale werken en tijdschriften. In 2010 promoveerde Diederik op een studie over de Historia Augusta, een collectie van Romeinse biografieën van laat-Romeinse keizers. Momenteel werkt hij aan de tekst en commentaar van Nazarius, een redenaar uit de tijd van Constantijn de Grote.